Erst in den letzten Jahren wurden seine Zeichnungen eingehend untersucht und nun erstmals umfassender dokumentiert. Mark Rothko hat sich im Laufe seiner Karriere mit einer Vielzahl von Medien beschäftigt, wobei er am häufigsten Aquarell, Tinte, Graphit und Buntstift sowie seine charakteristische Auswahl an Ölfarben verwendet hat. Sein spontaner Output war so groß, dass er vieles in kleinen Skizzenbüchern fertigte, in denen er seine Arbeiten flexibel zusammenstellen konnte, wann immer er wollte. Einige seiner Lieblingszeichnungen wurden dann aus den Skizzenbüchern entfernt und blieben als zerbrechliches einzelnes, loses Blatt Papier zurück. Dies hätte unweigerlich dazu geführt, dass einige davon in den Jahren seit Beginn seiner Karriere verloren gegangen oder beschädigt worden wären.
Die Themen von Rothkos Zeichnungen würden ebenfalls erheblich variieren. Er schuf Porträts, Landschaften und Szenen häuslicher Natur. Der Künstler hatte mehrere Orte, an die er mehrfach zurückkehrte, und diese tauchen in seinen Arbeiten auf, wie Portland, OR, Lake George, NY, und Cape Ann, MA. Nach seinem Umzug nach New York City passte er seine Arbeit an, um sich von den künstlichen Strukturen dieser Stadt inspirieren zu lassen, ähnlich wie Piet Mondrian die Stadt aus der Vogelperspektive einfing. Der Künstler fand in dieser weitläufigen Metropole auch Gleichgesinnte, die ihn ermutigten, die von ihm eingeschlagene künstlerische Richtung fortzusetzen, aber auch andere Einflüsse in seine Arbeit einfließen zu lassen.
